Nella puntata della terza stagione di Pretty Little Liars, andata in onda ieri sera su Mya, Aria (Lucy Hale) è influenzata e costretta a rimanere in casa da sola, affidandosi alle cure di Meredith (Amanda Schull) poiché suo padre (Chad Lowe) è partito per una conferenza, inoltre vuole evitare di incontrare sua madre (Holly Marie Combs) per non parlarle del diario di Ali (Sasha Pieterse). Toby (Keegan Allen) informa Mona (Janel Parrish) che Spencer (Troian Bellisario) non gli ha ancora rivelato che A si è rifatto vivo, poi entrambi si apprestano a eseguire gli ordini impartiti da A. Emily (Shay Mitchell) va da Toby con una scusa e riesce ad avere le sue chiavi di casa che serviranno a Spencer per organizzare una cena a sorpresa per festeggiare il loro anniversario. Hanna (Ashley Benson) si prepara a un colloquio di lavoro con la designer Corin e chiede consiglio a Caleb (Tayler Blackburn) su quale vestito indossare ma, quando si allontana per andare a provare un abito, sente una conversazione telefonica in cui il ragazzo dice di voler impedire che qualcuno le faccia ancora del male e fissa un appuntamento nel pomeriggio col suo interlocutore. Quando Hanna chiede spiegazioni, Caleb dice di aver chiamato sua madre e che entrambi hanno paura di quello che potrebbe fare Mona. Paige (Lindsay Shaw) dice a Emily di aver deciso di seguire il suo consiglio e nel pomeriggio vedrà qualcuno con cui parlare dei suoi problemi di ansia. Hanna, insospettita dalla telefonata di Caleb, chiede a Emily di seguirlo dopo la scuola per vedere dove va. Aria non trova il cellulare e chiede a Meredith di avvisare sua madre ma lei dice a Ella che la figlia sta meglio e poco dopo si scopre che è stata lei a prenderle il cellulare. Hanna arriva da Corin ma viene aggredita da qualcuno che inavvertitamente lascia cadere una chiave attaccata a un portachiavi con su scritta una A mentre sul suo cellulare arriva un messaggio di minaccia firmato proprio da A. Emily sta per scoprire con chi si deve incontrare Caleb quando riceve un messaggio di Spencer che la avvisa dellaggressione subita da Hanna e le chiede di raggiungerla, quindi si allontana senza vedere che Caleb ha appuntamento con Paige. I due hanno deciso di allearsi per mettere i bastoni tra le ruote a Mona e trovare la famosa stanza dei trofei dove lei aveva conservato tutti i segreti che utilizzava per ricattare le ragazze. Una persona si introduce in camera di Aria mentre lei dorme e fruga tra le sue cose, poi prende una bambola e sta per andar via quando Aria si sveglia e chiede cosa stia facendo: quando la persona si volta, si scopre che è Alison. La ragazza dice ad Aria di vedere A ovunque, che A è sempre intorno a loro e che la sorprende che Spencer non labbia capito, poi, dopo aver confessato che ricattava Byron, le sconsiglia di non bere la tisana di Meredith. Aria si risveglia dal sogno e, ritrovandosi segregata in camera, capisce che Meredith lha drogata. Intanto Emily e Hanna scorgono Meredith in una farmacia mentre litiga col farmacista perché non vuole darle del Clonazepam, un potente sonnifero, poi la vedono fare incetta di antistaminici e si insospettiscono, quindi decidono di andare a casa di Aria. Toby fa una sorpresa a Spencer presentandosi a casa con un mazzo di fiori e sul mobile trova la chiave con la A quindi chiede spiegazioni ma Spencer gli dice che la chiave appartiene a Melissa e la conserva in un cassetto. Per difendersi da Meredith, Aria rompe uno specchio e ne prende una scheggia da usare come arma ma si riaddormenta e al suo risveglio scopre che Meredith lha scoperta. Prova a scappare però la donna la raggiunge e la stordisce. Emily e Hanna arrivano da Aria ma trovano solo Meredith che con un tranello le fa scendere nel seminterrato e le chiude lì insieme ad Aria. Da una finestrella, le ragazze vedono arrivare Byron che è tornato prima dalla conferenza dopo aver ricevuto un messaggio di Meredith ed essere stato informato che sua figlia e le sue amiche sanno tutto. Le ragazze sospettano che Byron sia daccordo con Meredith ma luomo le libera e racconta la sua versione: dopo aver comunicato ad Alison che non avrebbe ceduto al suo ricatto era andato via, ma aveva visto Melissa parlare al telefono poco lontano da loro e quindi forse le due ragazze si erano incontrate.
Nel frattempo qualcuno si intrufola in casa di Spencer e scava nel cassetto dove la ragazza aveva nascosto la chiave, ma lei lo sorprende e ha la conferma che si tratta di Toby. Quel giorno, infatti, mentre preparava la cena da lui, aveva trovato il pass per entrare al Radley. L’arrivo della madre di Spencer, però, permette a Toby di scappare senza dare spiegazioni. Byron vorrebbe andare alla polizia a raccontare del suo incontro con Alison ma Aria, che ha deciso di credergli, lo ferma e brucia le pagine del diario. Spencer va da Toby per cercare di capire cosa c’è sotto ma la porta è chiusa dall’interno con un lucchetto. Lei lo implora di spiegarle ma dentro casa c’è solo Mona, seduta al tavolo a godersi la cena dell’anniversario.
Trama puntata 18 aprile 2013 – Un pacco ricevuto da Emily apre un nuovo scenario e rivela altri segreti di Alison. Hanna scopre il patto tra Caleb e Paige, mentre Aria cerca di sistemar il rapporto con suo padre. Spencer non riesce a confidare alle amiche quello che ha scoperto e, sentendo di meritare la punizione di A, si allontana sempre più da loro.